第一章講的是哲學思想，開篇就說宇宙由“元氣”構成。

元氣是一種混沌物質，然後衍化出陰陽、五行、萬物。所有的衍化過程，都必須遵循物理規則，這些物理規則是可以探索、發現、總結的。

他還認為，數學玄奧無比，物理規則可以用數學來表達。

並強化王安石「天人不相干」的思想，認為天地自有其運行規則，不是鬼神或者人類可以乾預的。

但人可以利用物理規則來做事，比如朱國祥的農學便是如此，比如火器的運用也是如此。